建所以來共取得科研成果600余項，成功研制出我國第一臺自行設計建造的1.2米回旋加速器，后改建為1.4米等時性回旋加速器并在其上完成新核素Pt-202的合成與鑒別，實現了我國在新核素合成領域零的突破；研制成功世界上第一臺超靈敏小型回旋加速器質譜儀；研制生產出我國第一個載入國家藥典的放射性藥物。承建并運行的上海光源是一臺高性能的中能第三代同步輻射光源，由中國科學院與上海市政府共同向國家建議和建設，于2004年底開工，按期于2009年4月竣工。上海光源是目前世界上性能最好的第三代中能同步輻射光源之一，也是我國迄今為止用戶最多的大科學裝置，是面向國內外用戶開放的國家重大科技基礎設施和大型科學研究平臺。迄今獲各類科技獎項200余項。上海光源國家重大科學工程及其團隊榮獲“2011年度中國科學院杰出科技成就獎”、“2012年度上海市科技進步特等獎”、“2013年度國家科技進步一等獎”；“重離子核反應的集體效應、奇異核產生及其性質研究”、“重質量豐中子新核素的合成鑒別和研究”獲國家自然科學二等獎；“相對論重離子碰撞中的反物質探測和夸克物質的強子譜學與集體性質研究”和“多元、協同生物傳感界面的設計、組裝及生物分析應用研究”同時獲2014年度上海市自然科學一等獎和2016年度國家自然科學二等獎；“全相干自由電子激光的前沿實驗研究與新原理探索”獲2018年度上海市自然科學獎一等獎。“上海光源國家重大科學工程”、“突破釷基核能系統核心技術，建成原型系統”入選中科院“十二五”重大科技成果及標志性進展。“合成新核素鉑-202”、“發現反氦核”、“建成上海光源”和“釷基熔鹽堆核能系統研發”等四個成果入選“中國科學院改革開放40年40項標志性科技成果”。                                                                              近幾年主要獲獎項目